大棚栽培灵芝是采用人工可控遮阴温棚，集约化栽培管理，标准化规模生产，所产的灵芝规格比较均匀，产量高，品质稳定可控，价格也更低。
野生灵芝的品质非常不可控，无法选择准确的采摘时间，还有可能遭遇污染、虫蛀等危害，很难获得品质较高的灵芝和灵芝孢子粉。
区别在于人工培养和户外自然生长。大棚灵芝是人工培植产物，相对野生灵芝在野外生长的价格低；大棚灵芝种养靠技术维持相对野生灵芝的产量很高；大棚灵芝的生长周期性短，野生灵芝的生长周期长；大棚灵芝比野生灵芝外观更漂亮。
形状区别：野生灵芝形状和大小各不相同。人工养殖的灵芝生长环境好。大小也都差不多，形状也有规则。
有无虫眼：野生灵芝会被虫害侵犯，留下虫眼。养殖灵芝不会出现虫眼。
气味区别：野生灵芝味道发苦，无异味。养殖灵芝会有别的气味。