过滤器的滤材种类根据不同的用途和过滤效果而有所差异。一般情况下，水族箱过滤器通常使用海绵、陶瓷环、活性炭、生化棉等材料作为滤材，用于去除悬浮颗粒物、氨氮、硝酸盐等有害物质。
空气净化器过滤器则通常采用HEPA滤网、活性炭滤芯等材料，用于去除PM2.5、甲醛、异味等污染物。具体应根据过滤器的型号和类型选择相应的滤材，并按照说明书进行更换和清洁。
将过滤器放入水族箱内，用吸盘固定在某一侧面上，打开开关即可使用。
注意事项：
1、过滤器只能按铭牌上面所标示的额定电压和频率使用。
2、每隔一段时间就应对过滤器进行保养。清洗及保养之前，将过滤器电源断开。
3、确保电线插头干燥。
4、不能用湿手拔掉电源线插头。
5、过滤器只限于室内水族箱中使用。
6、过滤器损坏时不能使用。
7、确保过滤器在正确的水位中工作，过滤器不能在无水情况下使用。
8、不能私自拆解或维修过滤器，以避免造成危险或对机体造成损坏，过滤器维修应由专业人士来进行。
首选过滤棉，其他的磁环，细菌屋，火山石，活性炭，珊瑚石都可以 ，便宜实用。
过滤材料分一般分三层。
第一层滤材： 称为物理过滤层，过滤棉，生化棉，魔毯等，一般放在第一层，以拦截大颗粒物为主，比如，鱼便，鱼粮，鳞片，等等，可以根据滤孔间隙大小混合搭配以及调整上下位置，也可将滤材整体抬高至水面以上，形成干湿分离，能达到更好的过滤效果。由于是拦截过滤的第一道防线，需要定期翻洗。
第二层滤材： 简称生物过滤，利用细菌屋，玻璃环，生化球，为硝化细菌提供适宜的着床环境，
达到分解水中氨氮含量的功用。硝化菌是好氧菌，滤材的表面越粗糙与水流接触面积越大，会对硝化菌的整体的繁殖与工作产生很大的帮助！如果是整体的细菌屋滤材，建议在滤材下方放置滤材垫板，可以抬高滤材使水流更好与滤材接触。
第三层滤材： 由火山石，珊瑚石，麦饭石，石英石，等有具体功用的特殊滤材组成。可以根据，饲养鱼只的品种，自身在养鱼过程中的需求，具体的添加此种滤材， 比如，火山石可将过酸或过碱的水质自动调节至中性，对罗汉，鹦鹉等鱼具有一定的诱色作用。 珊瑚石 适用于软水区，过滤中投放珊瑚石可以提高水的PH值。而我国北方水质偏硬的鱼友要慎用， 而活性炭 其吸附能力强大，水质出现浑浊，或者药浴后有药物残留可以起到快速清水的作用，但是不建议长期使用。